Oui aux deux ...
En cas de surpopulation, les déchets produits par les poissons ne peuvent pas être tous consommés par les bonnes bactéries et par les plantes. Donc montée de nitrates, nitrites, et potentiellement ammoniaque.
Dans le cas d'une plante qui meurt, elle produit des déchets en mourant, et en plus, elle ne consomme plus les déchets comme le fait une plante vivante. Donc risque de montée de nitrates et nitrites aussi.

Pour contrer cela, pas 36 solutions :
Changements d'eau réguliers, importants et souvent, réduire l'alimentation, et réduire la surpopulation le plus rapidement possible !