Si tu pouvais faire un effort de relecture, ce serait appréciable. Tu n'es pas facile à comprendre, j'ai du relire 3 fois avant de comprendre que "comme si sa tomber en l'embau" voulait  dire comme si ça tombait en lambeaux.

Pour vider mes bacs, je fais un siphon avec un tuyau: j'aspire dans le bac, l'autre bout du tuyau dans un seau au dessous du bac, et quand j'ai atteint le niveau voulu je retire le tuyau.

Changer plus de la moitié du bac doit rester exceptionnel car effectivement, cela peut perturber l'équilibre du bac. Mais un traitement perturbe cet équilibre quoi qu'il arrive, et il faut bien éliminer le traitement à la fin. Donc tu peux changer la moitié du bac dans ce cas là.

Du à la même maladie oui et non.

Son "trou blanc" est une blessure qui s'est infectée, la pourriture des nageoires est une infection bactérienne.
Donc la cause est la même: un environnement non adapté (à cause des 2 poissons rouges au minimum) qui est donc propice au développement de maladies.

Après te dire si c'est exactement la même bactéries dans les deux cas, ça je n'en sais rien !

Peux-tu mettre temporairement tes poissons rouges ailleurs ?
Dans un grand seau, une grande bassine en plastique propre ou autre ?
Parce que eux ne sont pas atteints, donc c'est un peu bête de les traiter...

Si vraiment il te semble mal ce soir, on va anticiper la fin de traitement, tu changes 10L d'eau et tu traites avec un antibactérien costaud:
baktopur direct de sera (en pastilles) ou furanol de JBL ou aquafuran de aquarium monster ou tout autre anti bactérien à base de nipurfirinol.
Si tu n'en trouves aucun près de chez toi, tu peux te rabattre sur le témérol d'aquascience, que je n'aime pas trop car parfois très mal toléré.
Si celui là non plus tu ne le trouves pas, tu traiteras au sel.

Bon courage.